Там он просто по-другому называется.А в Win98, как я понимаю, файл cmd.exe отсутствует.
command.com является командным процессором для MS-DOS и Windows 95/98.
Наверно самым правильным способом будет чтение буфера консоли. Тогда можно будет найти строку с командой запуска текущего приложения и узнать весь текст команды, включая возможные изменения потока.