BDE - это набор библиотек. Стало быть для перезагрузки BDE ДОСТАТОЧНО перезапустить все приложения, которые используют эти библиотеки.
С другой стороны при неверном восстановлении после ошибки могут остаться: неосвобожденная память, залоченные файловые ресурсы (например, временные файлы) и другие неосвобожденные хэндлы объектов операционной системы. Она будет считать эти хэндлы действительными и не даст открыть залоченный файл, или сама наткнется на хэндл, работа с которым приведет к ошибкам в ее ядре.
Так что УВЫ, единственное решение - найти ошибку и избавиться от нее!